106年6月1日全台強降雨，造成雲林大淹水，其中大湖口溪與石牛溪多處河段溢堤，造成淹水災害。當時立委劉建國立即在6月3日邀請總統蔡英文到雲林巡視災情，劉建國同時當面向蔡英文總統表示「河川治理的經費、方法、執行力都沒有到位，常淹水地區的整治經費應該要一次到位」，對此蔡英文總統也表示認同，並當場指示水利署積極重視雲林治水工程。
在立委劉建國的協助下，行政院針對大湖口溪以及石牛溪分別直接撥款11.8億元以及24.3億，總共36.1億元的經費，用於兩條溪流整治，同時水利署也比照新北市的員山子分洪施工模式，徵調其他河川局支援趕辦，總動員約2.5萬施工人次及2.4萬輛各型施工車次，讓原定於113年底完工的大湖口溪，在111年底就迅速完工，同時水利署也表示石牛溪亦可望於今年底完工。
立委劉建國表示，在106年6月1日，當時這樣的一個極端氣候與急降雨，讓全國各地都有災情，當時雲林縣尤其嚴重，石牛溪下游有一個安養院，當天晚上緊急撤離了50幾個住民。隔了兩天蔡總統就趕到雲林來會勘，我與水利署有正式跟總統特別要求、拜託，面對這樣的極端氣候，整個的疏濬的期程應該要再往前，以前都是在6月才開始啟動，我們希望農曆過年後就要馬上疏濬。
劉建國指出，因為106年的淹水，雲林縣做一個總檢討，當時的情況叫做溢堤，而不是潰堤，也就是說河堤的設計高度，基本上是還是足夠的，不過因為疏濬的期程一直沒有辦法提前，所以導致很多的河川的飽和容量已經不足，但如果有疏濬，或許溢堤的地方會減少，可以降低很多淹水的災情。
劉建國也提到，雲林縣針對大湖口溪、石牛溪以及其他河川等，過去在施工的方式都是比較片段的，例如在人口密集的地方還是河道轉彎處，有進行工程施作，但是遇到極端氣候的情況之下，很多沒有施作的地方，反而成為洪水氾濫的突破口，所以我才特別拜託蔡總統，整個河川的治理經費應該一次到位，分年來施作。
劉建國最後特別感謝水利署以及第五河川局全體同仁，此次大湖口溪以及石牛溪，水利署是比照員山子分洪施工模式，特別去征調其他的河川局來趕工完成，所以原本是預計五年的工期，現在經縮短了兩年變成三年完工，同時也應該有一段時間，大家也都沒有聽到我們這地方有淹水的災情發生，因此很感謝蔡總統，也感謝水利署還有這個第五河川局所有同仁的努力不懈。
水利署賴建信署長也表示，非常感謝劉建國委員對大湖口溪以及石牛溪的重視。尤其在106年6月2日西南氣流來襲，降下超大豪雨，導致尚未完成治理的大湖口溪、石牛溪等多處河段溢堤，造成淹水災害。當時蔡總統在劉建國委員等陪同及建議下，特別指示相關治理經費應一次到位，再分期推動工程；行政院立刻協助經濟部籌應所需經費，並一次核定所有計畫工程，使得改善工程以全面展開改善工作，再次感謝劉委員的全力支持。
